Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP62P37198 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms