Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THBS4P35443 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THBS4P35443 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms