Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA4P35212 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA4P35212 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA4P35212 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA4P35212 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms