Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRS3P32247 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRS3P32247 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms