Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP1P29466 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP1P29466 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CASP1P29466 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CASP1P29466 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP1P29466 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms