Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX2P28328 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms