Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMLP26374 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMLP26374 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMLP26374 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms