Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms