Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms