Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA1P25786 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms