Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
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