Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPREP23469 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPREP23469 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPREP23469 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPREP23469 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPREP23469 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPREP23469 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPREP23469 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPREP23469 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPREP23469 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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