Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms