Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCL3P20749 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCL3P20749 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCL3P20749 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCL3P20749 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCL3P20749 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms