Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSP20132 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSP20132 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSP20132 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms