Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME1P15531 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME1P15531 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME1P15531 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME1P15531 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms