Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms