Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms