Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DMDP11532 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DMDP11532 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DMDP11532 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DMDP11532 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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