Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms