Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms