Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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