Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD74P04233 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CD74P04233 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CD74P04233 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms