Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms