Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV3-7P01780 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-7P01780 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms