Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL3O95236 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms