Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms