Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms