Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms