Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB2O43741 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms