Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DENRO43583 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DENRO43583 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms