Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD6O43541 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms