Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYNJ2O15056 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNJ2O15056 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms