Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms