Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms