Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms