Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms