Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms