Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms