Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms