Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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