Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP3BA6NNM3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP3BA6NNM3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms