Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms