Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3CA6NKF2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms