Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms