Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms