Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms