Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms