Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms