Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms